Section: Dissemination

Teaching - Supervision - Juries

Teaching

• L2 informatique: Raphaël Truffet, Génie Logiciel, 24h and Complexity, 18h, L2, ISTIC, France,

• L2 informatique: Raphaël Truffet, Génie Logiciel, 40h, L2, ISTIC, France

• ENS Rennes: Raphaël Truffet, Algorithmic (20h)

• L2 biologie: Antoine Legouhy, Bio-statistques 34h, L2, Univ. Rennes 1, France.

• M1 mathématiques: Antoine Legouhy, Optimisation 12h, M1, Univ. Rennes 1, France.

• M1 biologie: Antoine Legouhy, statistiscs 12h, M1, Univ. Rennes 1, France.

• Master SIBM, M2, University of Angers-Brest-Rennes, France.

• L1 INF1: Francesca Galassi, Functional and Immutable Programming (Scala) (TP : 40h), L1, ISTIC University of Rennes 1, France.

• L3 bioinformatique: Corentin Vallée, Statistics, 32h, University of Rennes 1, France.

• Master SIBM: Benoit Combès, Statistics (TD, TP: 12h), University of Angers-Brest-Rennes:

  • Emmanuel Caruyer, “Introduction to diffusion MRI” (Plenary: 3h).

  • Benoit Combès, “Méthodes de recalage linéaire et non-linéaires” (Plenary: 6h)

  • Quentin Duché, “Traitements des données d'IRM fonctionnelle” (Plenary: 1h).

  • Isabelle Corouge, “Bio-marqueurs d’imagerie et IRM metabolique et fonctionnelle” (Plenary: 3h).

  • Camille Maumet, “Imaging processing pipelines” (Plenary: 3h).

  • Élise Bannier, “IRM fonctionnelle BOLD” (Plenary: 1h).

  • Benoit Combès, “Méthodes statistiques pour le traitement d'image” (Plenary: 3h).

  • Claire Cury, "Evaluation des performances en imagerie médicale" (Plenary: 3h). item Julie Coloigner, "Méthodes d'analyse de la connectivité cérébrale" (Plenary: 3h).

• Master 2 "Langage Cognition et Apprentissage: Pierre-Yves Jonin,"Méthodologie clinique & psychométrique de l'étude de cas" (4h); Université de Poitiers, February 2019

• DIU Sémiologie des démences: Pierre-Yves Jonin, "Diagnostic précoce de la maladie d'Alzheimer: contribution neuropsychologique" (4h); Université de Caen Basse Normandie, March 2019

• Master 2 Neuropsychologie: Pierre-Yves Jonin, "Apports et limites du bilan neuropsychologique à visée diagnostic dans les syndromes démentiels" (3,5h); Université de Savoie à Chambéry, March 2019

• Licence 3 Psychologie, UES Handicap: Pierre-Yves Jonin "Déficit mnésique et handicap invisible. Détection en neuropsychologie" (8 h); Université de Rennes 2, February 2019

• Master 2 Psychologie spécialité handicap: Pierre-Yves Jonin "Neuropsychologie clinique du sujet âgé" (10 h); Université de Rennes 2, January-April 2019

• Medicine (4th & 5th year) UE Psychologie et Neurobiologie: Pierre-Yves Jonin,L’exploration neuropsychologique des maladies neurologiques et psychiatriques. 4ème & 5ème année de médecine (4h), Université de Brest, France.

• Licence 3 de Psychologie: Pierre-Yves Jonin, Les syndromes neuropsychologiques. L3, (16h); Université de Rennes 2, France

• Master 2 "Troubles de la Cognition et du Langage": Pierre-Yves Jonin, Evaluation neuropsychologique à visée diagnostique. Le cas des syndromes démentiels. Master 2 (2 x 6h) Université de Poitiers, France.

• Master 2 Neurosciences Cliniques: Pierre-Yves Jonin, "La mémoire humaine" (3h); Université de Rennes 1, novembre 2019

• IUT St-Malo: Mathis Fleury, statistics (64); 2019

• Licences 2 & 3 Biologie: Xavier Rolland, "Introduction aux Biostatistiques" 1 (TP sur R: 64h), Université de Rennes 1

• ESIR: Pierre Maurel, General image processing (60h), Algorithmics and complexity (60h), Medical imaging (60h), École Supérieure d’Ingénieur de Rennes (ESIR).

• ENS Rennes: Pierre Maurel, Introduction to image processing (24h)

Supervision

PhD & HdR

• HDR: Olivier Commowick, "Compartments imaging for the characterization of brain diseases from quantitative MRI", Univ. Rennes 1, defended on June 19, 2019, jury: Isabelle Bloch - Professeur, Telecom Paristech, Sébastien Ourselin - Professeur, King’s College London, Jean-Philippe Thiran - Professeur, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Christian Barillot - DR CNRS, Equipe Empenn, Alexander Leemans - Associate Professor, UMC Utrecht and Xavier Pennec - DR Inria, Equipe Epione[1].

• PhD: Anne-Claire Binter, “Effects of prenatal exposure to neurotoxicants on the child's brain function evaluated by cerebral imaging”, defended on December 4, 2019, Univ. Rennes, Élise Bannier.

• PhD: Cédric Meurée, “Arterial spin labelling : quality control and super-resolution”, defended on March 25, 2019, Univ. Rennes, Pierre Maurel, Christian Barillot.

• PhD: Haykel Snoussi, “Population imaging and diffusion MRI for characterizing multiple sclerosis in the human spinal cord.”, defended on May 2, 2019, Univ. Rennes, Christian Barillot and Emmanuel Caruyer[3].

• PhD in progress: Antoine Legouhy, “Longitudinal brain altas creation, application to development studies”, CNRS, from Nov 2016, Defence planned for February 2020, Christian Barillot, François Rousseau, Olivier Commowick.

• PhD in progress: Corentin Vallée, “Joint estimation of neuronal activation, resting-state and basal metabolism from Arterial Spin Labeling”, Univ. Rennes, from Nov 2016, Christian Barillot, Isabelle Corouge, Pierre Maurel.

• PhD in progress: Xavier Rolland, “Modeling analytic variability in brain imaging”, CNRS, from Oct 2018, Christian Barillot, Camille Maumet.

• PhD in progress: Raphaël Truffet, “Compressed sensing for microstructure-enabled diffusion MRI”, Univ. Rennes / ENS Rennes, from Oct 2018, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer.

• PhD in progress: Giovanna Orrù, “Modeling brain structural and functional connectivity ”, Univ. Rennes, from Oct 2019, Julie Coloigner and Christian Barillot.

• PhD in progress: Stéphanie Leplaideur, "Equilibre de la rééducation par vibrations cervicales, adaptation prismatique et association aux deux techniques, chez des patients cérébro-lésés droits– Protocole AVC POSTIM " , started in October 2018, Isabelle Bonan, Élise Bannier.

Other supervisions

• Master student SIF (Master mention Informatique, parcours Science informatique): Antoine Ackaouy, “Deep learning for segmentation of MS lesions from multimodal MRI”, Apr-Oct 2018, Francesca Galassi.

• 3-months visit: Gregory Kiar, PhD student, "Analytical Stability in fMRI" April-June 2019, Camille Maumet in collaboration with Elisa Fromont (LACODAM, Inria Rennes / IRISA).

• Co-supervised project : Alexander Bowring, "Exploring the Impact of Analysis Software on Task fMRI Results" 2019, Camille Maumet in collaboration with Thomas Nichols (LACODAM, Inria Rennes / IRISA).

• Co-supervised project : Freya Acar, Best practices reporting for fMRI meta-analysis 2019, Camille Maumet in collaboration with Beatrijs Moerkerke (LACODAM, Inria Rennes / IRISA).

• M1 Physique Médicale student: Marion Boulanger, "Evaluation of QC procedures at Neurinfo and optimisation".

• L3 ESIR Ingénierie Biomédicale student: Chloé Mercier, "Implementation of a Java tool to perform MR Quality Control on a Eurospin test object".

Juries

• Emmanuel Caruyer. PhD committee: Yann Bihan-Poudec, Université Claude Bernard Lyon 1; December 17, 2019.

• Olivier Commowick. PhD committee: Junhao Wen, "Structural and microstructural neuroimaging for diagnosis and tracking of neurodegenerative diseases", Sorbonne Université; July 4, 2019, PhD supervisors: Olivier Colliot et Stanley Durrleman.

• Olivier Commowick. MD thesis committee: Charlotte Laurent "Intérêt pronostique de l’IRM en tenseur de diffusion dans les neuropathies optiques inflammatoires", Université de Rennes 1; Octobre 25, 2019.

• Olivier Commowick. PhD committee: Christian El Hajj "Estimation et classification des temps de relaxation multi-exponentiels en IRM. Application aux tissus végétaux.", Ecole centrale Nantes; December 16, 2019, PhD supervisors: Guylaine Collewet and Maja Musse.